中医针灸理疗师证书是国家职业资格证书，由国家人力资源和社会保障部颁发，目前，国内有多个部门可以颁发中医针灸理疗师证书，如中国中医科学院、各省市中医院、卫生职业学院等。

中国中医科学院是最具有权威性的颁发机构之一，该机构成立于1955年，是中国最高级别的中医药科研机构之一，也是国家中医药管理局直属事业单位，中国中医科学院拥有一支高水平的专家团队和完善的实验设施，其颁发的证书具有很高的含金量和认可度。

各省市中医院也可以颁发中医针灸理疗师证书，这些医院通常都设有专门的康复科或针灸推拿科，并拥有一定的师资力量和临床经验，虽然这些证书的含金量可能不如中国中医科学院颁发的证书高，但也具有一定的参考价值。

卫生职业学院也可以颁发中医针灸理疗师证书，这些学院通常都是为了培养医疗人才而设立的，其师资力量和教学设施都比较优秀，从教育质量上来说，卫生职业学院颁发的证书也是值得信赖的。

如果您想要考取一份权威性强、含金量高的中医针灸理疗师证书，建议选择中国中医科学院颁发的证书；如果您对某个省市的中医院比较信任，也可以选择该医院颁发的证书；如果您想接受系统的专业培训并获得相应的学历证书，可以选择卫生职业学院颁发的证书，当然，无论您选择哪个部门颁发的证书，都需要认真备考并通过相应的考试才能获得这份荣誉。