国际商务单证员证书颁发机构主要包括以下几个部门：

1、国家工商行政管理总局：作为国家级政府部门，国家工商行政管理总局负责制定和实施与商务单证相关的法律法规，对商务单证员的培训、考试和证书颁发进行统一管理和监督，国家工商行政管理总局下设的各地市场监管局也会参与到商务单证员证书的颁发工作中。

2、教育部：教育部门负责商务单证相关课程的设置和教材编写，对商务单证员的培训和考试进行指导和支持，教育部门还会与其他相关部门合作，共同推动商务单证领域的发展。

3、人力资源和社会保障部：人社部门负责商务单证员职业资格的认证和管理，对商务单证员的职业技能进行评价和认证，人社部门还会组织商务单证员的培训和考试，确保其具备一定的业务能力和素质。

4、国际商务协会：国际商务协会是一个专业性的行业协会，致力于推动国际商务的发展，该协会会组织商务单证员的培训和考试，制定行业标准和规范，为商务单证员提供一个交流和学习的平台。

5、各大高校：国内许多高校都设有国际商务、物流管理等相关专业，这些学校会承担商务单证员的培训任务，为学生提供理论知识和实践技能的学习机会，高校还会与企业合作，为商务单证员提供实习和就业机会。

6、培训机构：为了满足市场需求，国内外众多培训机构纷纷开设了国际商务单证员培训课程，帮助学员掌握商务单证的基本知识和技能，这些培训机构通常由具有丰富经验的教师授课，以确保培训质量。

7、企事业单位：许多大型企业和跨国公司也会设立专门的商务部门，负责处理国际贸易中的单证工作，这些企业会自行组织或委托培训机构对员工进行商务单证员培训，提高员工的业务能力。

8、其他政府机构：除了上述部门外，还有一些地方政府部门和行业协会也会参与到商务单证员证书的颁发工作中，共同推动商务单证领域的发展。

国际商务单证员证书颁发机构涉及多个部门和领域，包括政府部门、教育机构、行业协会、企事业单位等，这些机构共同努力，为培养合格的商务单证员提供了有力的支持和保障。