中医针灸师证办理机构主要负责对中医针灸师进行资格认证和培训，以确保针灸师具备相应的专业知识和技能，在中国，有多个单位负责办理中医针灸师证，以下是一些主要的办理机构：

1、国家中医药管理局：国家中医药管理局是中国政府部门，负责制定和实施中医药行业的政策、法规和标准，在中医针灸师证的办理方面，国家中医药管理局会定期组织中医针灸师资格考试，并对合格者颁发证书。

2、各省、自治区、直辖市中医药管理部门：各级中医药管理部门在国家中医药管理局的指导下，负责本辖区内中医针灸师证的办理工作，他们会组织本地区的中医针灸师资格考试，并对合格者颁发证书。

3、中医药大学及其附属医疗机构：中国的中医药大学在培养中医针灸师方面具有悠久的历史和丰富的经验，这些学校的附属医院通常也会提供中医针灸师培训课程，并协助学生进行中医针灸师证的办理。

4、社会培训机构：除了上述官方机构外，还有一些社会培训机构也提供中医针灸师培训课程，这些机构可能会与中医药大学或中医药管理部门合作，帮助学员顺利完成中医针灸师证的办理。

5、中国民间中医药协会：中国民间中医药协会是一个非营利性社会组织，致力于推广和发展中医药事业，该协会可能会组织中医针灸师培训课程，并协助学员完成中医针灸师证的办理。

6、中国针灸推拿协会：中国针灸推拿协会是一个专业性社会组织，致力于推动针灸推拿事业的发展，该协会可能会提供中医针灸师培训课程，并协助学员完成中医针灸师证的办理。

中医针灸师证的办理涉及多个部门和机构，包括国家中医药管理局、各省、自治区、直辖市中医药管理部门、中医药大学及其附属医疗机构、社会培训机构等，想要获得中医针灸师证的人，可以根据自己的实际情况选择合适的办理机构进行学习和考试。