针灸师证和针灸门诊证是两个不同的证书，它们分别代表了不同的资格和能力，针灸师证是指具备一定的中医理论知识和临床操作技能，能够独立进行针灸治疗的人员所获得的证书，而针灸门诊证则是指在医疗机构内，经过相关部门审批，具备开设针灸门诊资格的人员所获得的证书。

关于是否可以同时办理这两个证书，目前国家并没有明确的规定，但是根据实际情况来看，如果你已经取得了针灸师证，那么在申请开设针灸门诊时，通常只需要提供针灸师证作为资格证明即可，而具体的办理流程和要求，可能因地区和单位的不同而有所差异。

建议你咨询当地的卫生行政部门或者相关行业协会，了解具体的办理流程和要求，你也可以参考一些相关的法律法规和政策文件，以便更好地了解自己的权利和义务。