中医针灸师证书的颁发部门有很多，其中包括国家中医药管理局、各省市中医药管理部门、中医药高等专科学校等，这些部门颁发的证书都是正规的，但是不同的部门对于针灸师的资质要求和考试内容可能会有所不同，如果您想考取中医针灸师证书，建议您先了解一下各个部门的考试内容和要求，再根据自己的实际情况选择适合自己的证书。

您还可以参考一些权威机构发布的中医针灸师证书排行榜，如中国中医药学会、中华医学会等，这些机构发布的排行榜通常会对各个部门颁发的证书进行综合评估，并给出相应的排名和评价，通过查看这些排行榜，您可以更加直观地了解各个部门颁发的证书的质量和水平。