新媒体运营师证书报名机构有很多，以下是一些比较知名的机构：

1、中国互联网新闻中心(中国网):中国互联网新闻中心是国内最大的互联网新闻信息服务平台之一，也是国内最早的互联网新闻信息服务提供商之一，该机构提供了新媒体运营师证书培训课程，包括新媒体营销、社交媒体管理、内容创作等方面的内容。

2、人民网：人民网是中国人民日报社旗下的一家综合性新闻门户网站，也是国内最具影响力的媒体之一，该机构提供了新媒体运营师证书培训课程，包括新闻写作、摄影摄像、视频制作等方面的内容。

3、新华网：新华网是新华社旗下的一家综合性新闻门户网站，也是国内最具影响力的媒体之一，该机构提供了新媒体运营师证书培训课程，包括新闻写作、摄影摄像、视频制作等方面的内容。

4、搜狐：搜狐是中国最大的门户网站之一，也是国内最具影响力的媒体之一，该机构提供了新媒体运营师证书培训课程，包括搜索引擎优化、社交媒体管理、内容创作等方面的内容。

5、腾讯：腾讯是中国最大的互联网公司之一，也是国内最具影响力的媒体之一，该机构提供了新媒体运营师证书培训课程，包括社交媒体管理、内容创作等方面的内容。

6、阿里巴巴：阿里巴巴是中国最大的电子商务公司之一，也是国内最具影响力的企业之一，该机构提供了新媒体运营师证书培训课程，包括电子商务平台管理、数据分析等方面的内容。

7、百度：百度是中国最大的搜索引擎公司之一，也是国内最具影响力的企业之一，该机构提供了新媒体运营师证书培训课程，包括搜索引擎优化、数据分析等方面的内容。

8、头条：今日头条是一款基于数据挖掘技术的推荐引擎产品，也是国内最具影响力的媒体之一，该机构提供了新媒体运营师证书培训课程，包括内容创作、数据分析等方面的内容。