针灸在长期的医疗实践中，形成了由十四经脉、奇经八脉、十五别络、十二经别、十二经筋、十二皮部以及孙络、浮络等组成的经络理论，和361个腧穴以及经外奇穴等腧穴与腧穴主病的知识，并发现人体特定部位之间特定联系的规律，创造了经络学说，并由此产生了一套治疗疾病的方法体系。

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因此人体功能装置不仅是人体形态功能的局部单元，也是针灸“切经”和针灸治疗的局部单元，这就是经络诊治的奥秘。针灸时第二个作用是镇痛疼痛，是一种非常复杂的感觉，因此，目前人们对痛觉生理以及镇痛作用原理的研究，都应当看作是初步的探讨。那么针灸为什么能止痛呢?中国古典医学认为，针灸所以能止痛，是因为针灸具有“疏通经络”的作用。在正常情况下，人的气血在经脉里运行畅通无阻，没有疼痛的感觉。如果有什么原因造成经脉里的气血运行不够通畅，就会产生疼痛，叫做“不通则痛”。针灸能够止痛，是因为针灸能使经脉里的气血运行通畅，这叫做“通则不痛”。但是，造成气血运行不畅的原因很多，所以针灸在临床上治疗疼痛的方法也不一样。比如风湿性疾病，这种病是由于风、寒、湿这些外邪侵犯人体，造成气血运行不通畅，因此治疗的时候，就应该使用散风、祛寒、利湿的方法进行治疗。又比如炎症性疼痛，这是由于体内蕴热、感受时邪，也就是某种细菌感染，造成气血壅滞，治疗这种疼痛，就应该采用清热消肿的方法。所以说，针灸镇痛，不是单纯的止痛，而是消除致病原因的结果。针灸的这种“通经脉”的作用，在临床上不仅用于镇痛，还可用于治疗闭经、产后奶水不足、半身不遂、局部冻伤等病。针灸的第三种作用是增强机体防卫免疫功能，这种功能中医叫做“扶正祛邪”。扶正，是扶助正气的意思，也就是增强机体抵抗力；祛邪，是驱除致病因素，也就是消灭细菌或病毒的意思等。医生治疗疾病可以从“扶助正气”方面入手，也可以从“驱除病邪”方面入手。或者扶正和祛邪两种方法同时并用。比如，人们得了传染病或者炎症性疾病，医生给一些抗生素，这是从“祛邪”方面进行治疗。消灭了致病的细菌，就等于扶助了人体的正气，所以叫做“祛邪扶正”。相反地，医生不给抗生素，而进行针灸，这是从扶正方面进行治疗。通过针灸来增强机体抵抗力，消灭致病的细菌，因此把这种作用叫做“扶正祛邪”。