心理咨询师证书是由国家相关部门颁发的，用于证明持证人具备从事心理咨询工作的能力和资格，在中国，心理咨询师证书的颁发主要由以下几个部门负责：

1、中国心理学会：中国心理学会是中国最高学术权威的心理学专业组织，其颁发的心理咨询师证书具有较高的权威性和认可度，中国心理学会的心理咨询师培训课程涵盖了心理学基础知识、心理咨询技能、伦理道德等方面的内容，旨在培养具备扎实理论基础和实践能力的心理咨询师。

2、国家卫生健康委员会：国家卫生健康委员会是中国政府主管卫生和健康工作的部门，其下属的心理卫生中心也负责心理咨询师证书的颁发，国家卫生健康委员会的心理咨询师培训课程注重实践操作能力的培养，学员需要通过实习和考核才能获得证书。

3、各省市心理卫生协会：各省市心理卫生协会是地方性的心理卫生专业组织，其颁发的心理咨询师证书在本地区具有一定的认可度，各省市心理卫生协会的心理咨询师培训课程通常与当地的心理健康服务需求相结合，注重培养具备实际操作能力的心理咨询师。

4、国际认证机构：除了国内相关部门颁发的心理咨询师证书外，还有一些国际认证机构在中国开展心理咨询师培训和认证工作，如美国心理学会（APA）、英国心理治疗师协会（UKCP）等，这些国际认证机构的心理咨询师证书在全球范围内具有较高的认可度，但在国内的认可度相对较低。

要选择哪个部门颁发的心理咨询师证书最好，需要根据个人的需求和目标来综合考虑，如果你希望在全国范围内从事心理咨询工作，那么中国心理学会或国家卫生健康委员会颁发的证书可能更具优势；如果你主要在本地区从事心理咨询工作，那么各省市心理卫生协会颁发的证书可能更合适；如果你有意向在国际范围内发展，那么国际认证机构的证书可能更有价值。

在选择心理咨询师证书时，还需要考虑以下几个方面：

1、培训课程的质量：不同的培训机构和部门提供的培训课程质量可能存在差异，因此需要了解课程设置、师资力量、实践环节等方面的信息，以确保培训效果。

2、培训费用：心理咨询师培训课程的费用因部门和课程内容的不同而有所差异，需要根据自己的经济状况来选择合适的培训项目。

3、考试难度和通过率：不同部门的心理咨询师考试难度和通过率可能有所不同，需要了解相关信息以便做好充分的准备。

4、证书的认可度：在选择心理咨询师证书时，还需要关注证书在行业内的认可度，以便为自己的职业发展打下坚实的基础。