如果您的高级文秘及办公自动化证书纸质版不见了，您可以尝试以下几种方法来解决这个问题：

1、您可以联系颁发该证书的机构，询问他们是否可以为您提供一份电子版证书，现在很多机构都提供电子版证书的服务，您可以通过电子邮件或者其他在线平台获取这份证书，虽然这并不是一份纸质版证书，但它同样具有法律效力，可以证明您已经完成了相应的培训和学习。

2、如果您非常在意这份证书的纸质版，那么您可以考虑重新申请一份，在这种情况下，您需要支付一定的费用，并且需要重新参加培训和考试，虽然这可能会花费一些时间和精力，但是这样您就可以获得一份全新的纸质版证书了。

3、如果您担心重新申请证书会浪费太多时间，您还可以尝试寻找一些专业的证书补办公司，这些公司通常会提供各种类型的证书补办服务，包括高级文秘及办公自动化证书，他们可以帮助您重新制作一份新的证书，以替代丢失的那份，不过，这种方法的费用可能会比较高，因此您需要权衡一下是否值得。

4、您还可以考虑将这个问题上报给相关的管理部门，如果您是在某个培训机构获得的证书，那么您可以向该机构反映这个问题，看看他们是否可以为您提供一些帮助，您还可以向当地的教育部门或者工商部门反映这个问题，看看他们是否可以为您提供一些指导和建议。

如果您的高级文秘及办公自动化证书纸质版不见了，您可以尝试以上几种方法来解决这个问题，希望这些建议能够对您有所帮助。