新媒体运营师证书报名机构有很多，以下是一些常见的机构：

1、中国传媒大学：中国传媒大学是国内最早开设新媒体专业的高校之一，其新媒体运营师证书课程内容丰富，教学质量有保障。

2、北京工业大学：北京工业大学的新媒体运营师证书课程注重实践操作，培养学生的实际操作能力。

3、华东师范大学：华东师范大学的新媒体运营师证书课程涵盖了新媒体运营的各个方面，包括内容创作、社交媒体管理、数据分析等。

4、上海交通大学：上海交通大学的新媒体运营师证书课程注重理论与实践相结合，帮助学生更好地掌握新媒体运营的技能。

5、中国人民大学：中国人民大学的新媒体运营师证书课程涵盖了新媒体运营的各个方面，包括内容创作、社交媒体管理、数据分析等。