中医健康管理师证颁发部门是指负责对中医健康管理师进行资格认证和颁发证书的政府部门或机构，在中国，中医健康管理师证的颁发主要由国家卫生健康委员会(原卫生部)和各省、自治区、直辖市卫生健康委员会负责。

国家卫生健康委员会是中华人民共和国国务院组成部门之一，主要负责全国卫生健康工作的规划、政策制定、监督指导等职责，国家卫生健康委员会下设多个司局，其中包括中医药管理局，负责中医药事业的发展和管理，根据《中华人民共和国中医药法》和相关法规，中医健康管理师证书是由国家卫生健康委员会中医药管理局负责审批和颁发的。

各省、自治区、直辖市卫生健康委员会也会根据地方实际情况，制定相应的中医健康管理师资格认证和颁发办法，这些地方卫生健康委员会在国家卫生健康委员会的指导下，负责本地区中医健康管理师的资格审核、培训和证书颁发工作。

中医健康管理师证颁发部门主要包括国家卫生健康委员会和各省、自治区、直辖市卫生健康委员会，这些部门通过严格的资格审核、培训和考试，确保中医健康管理师具备扎实的专业知识和技能，为人民群众提供优质的中医健康服务。