针灸师证和针灸门诊证是两个不同的概念，针灸师证是指通过国家中医药管理部门认可的针灸专业培训和考核，取得的针灸师资格证书，而针灸门诊证是指在医疗机构开设针灸诊疗服务，需要经过卫生行政部门审批，取得的诊所执业许可证。

如果您已经取得了针灸师证书，可以在医疗机构开设针灸门诊服务，具体办理流程如下：

1、选择合适的医疗机构：您需要先选择一家具备开设针灸门诊条件的医疗机构，如医院、中医诊所等。

2、提交申请材料：向该医疗机构提交申请开设针灸门诊的相关材料，包括身份证、针灸师证书、医疗机构执业许可证等。

3、卫生行政部门审批：卫生行政部门会对您的申请材料进行审核，如果符合条件，会批准您开设针灸门诊。

4、办理诊所执业许可证：获得卫生行政部门的批准后，您需要到当地工商行政管理部门办理诊所执业许可证。

5、缴纳相关费用：根据不同地区的政策，您可能需要缴纳一定的开办费用，具体费用可以咨询当地卫生行政部门或工商行政管理部门。

6、开展业务：在完成以上手续后，您就可以在医疗机构开设针灸门诊服务了。

需要注意的是，不同地区的办理流程和要求可能会有所不同，建议您向当地的卫生行政部门和工商行政管理部门咨询具体的办理流程和要求，开办针灸门诊还需要具备一定的专业知识和技能，建议您在开设门诊前进行相关的培训和学习。