中医针灸师证办理机构主要由以下几类单位进行审批：

1、卫生行政部门：卫生行政部门是中医针灸师证办理的主要审批机构，负责对申请中医针灸师证的人员进行资质审查、技能考核和培训等工作，在中国，卫生行政部门主要包括国家卫生健康委员会、各省、自治区、直辖市卫生计生委等。

2、中医药管理部门：中医药管理部门负责对中医药行业的管理和发展，包括中医针灸师证的审批，在中国，中医药管理部门主要由国家中医药管理局、各省、自治区、直辖市中医药局等组成。

3、教育培训机构：为了提高中医针灸师的专业技能和素质，各地教育培训机构也会参与中医针灸师证的办理，这些机构通常具有一定的师资力量和教学设施，能够为学员提供系统的中医针灸师培训课程，在中国，知名的教育培训机构有北京中医药大学、上海中医药大学等。

4、行业协会和组织：各地的中医针灸行业协会和组织也会参与中医针灸师证的办理，这些协会和组织通常具有一定的行业影响力和专业性，能够为申请中医针灸师证的人员提供一定的参考和帮助，在中国，知名的中医针灸行业协会和组织有中国针灸学会、中华中医药学会等。

5、企事业单位：一些企事业单位也会开展中医针灸师培训工作，并为其员工提供中医针灸师证书，这些单位通常具有一定的实力和资源，能够为学员提供较好的培训环境和条件，在中国，知名的企事业单位如中信集团、阿里巴巴集团等。

6、其他相关机构：还有一些其他相关机构也会参与中医针灸师证的办理，如职业资格考试中心、人才市场等，这些机构通常具有一定的专业知识和服务能力，能够为申请中医针灸师证的人员提供便捷的办理服务。

中医针灸师证办理机构涉及多个部门和单位，主要包括卫生行政部门、中医药管理部门、教育培训机构、行业协会和组织、企事业单位以及其他相关机构，申请人在办理中医针灸师证时，可以根据自己的实际情况选择合适的办理机构进行咨询和报名。