中医针灸师证考试的科目包括：中医基础理论、针灸学、中药学和实践操作考试，中医基础理论包括中医基础概念、中医诊断、中药学等内容；针灸学包括经络、穴位、针灸手法等方面的知识；中药学包括中药的分类、功效、应用等方面的知识；实践操作考试包括模拟病人诊断、针灸操作等内容 。