中医针灸师证办理机构有很多，以下是一些常见的机构：

1、中国中医科学院针灸研究所：该研究所是国内著名的针灸科研机构之一，也是国家中医药管理局直属事业单位，该研究所拥有一支高水平的针灸专业团队，可以为学员提供全面的培训和指导。

2、北京中医药大学东方医院：该医院是一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等中西医结合医院，该医院拥有一支由多名知名中医针灸专家组成的教师团队，可以为学员提供优质的教学服务。

3、上海中医药大学附属曙光医院：该医院是一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等中西医结合医院，该医院拥有一支由多名知名中医针灸专家组成的教师团队，可以为学员提供优质的教学服务。

4、广州中医药大学附属第一医院：该医院是一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等中西医结合医院，该医院拥有一支由多名知名中医针灸专家组成的教师团队，可以为学员提供优质的教学服务。

5、成都中医药大学附属医院：该医院是一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等中西医结合医院，该医院拥有一支由多名知名中医针灸专家组成的教师团队，可以为学员提供优质的教学服务。