在寻找按摩理疗师证的办理部门时，你需要考虑以下几个因素：证书的权威性、培训的质量、费用以及地理位置等，在中国，有多个机构提供按摩理疗师的培训和证书颁发，其中包括一些知名的健康和医疗机构，以下是一些可能的选择：

中国康复研究中心：这是一家位于北京的研究机构，专门从事康复医学的研究和服务，他们提供了全面的按摩理疗师培训课程，包括理论学习和实践操作，该中心的证书被广泛认可，可以在国内和国际上使用。

中国中医科学院广安门医院：这家医院是中国著名的医疗机构之一，也提供按摩理疗师的培训课程，他们的教师团队由经验丰富的专业人员组成，能够提供高质量的教学。

其他省级卫生行政部门：在中国，每个省或自治区都有自己的卫生行政部门，负责管理和监督医疗行业，这些部门可能会提供按摩理疗师的培训课程和证书颁发服务。

私人培训机构：除了官方的机构外，还有一些私人培训机构也提供按摩理疗师的培训课程，这些机构的优点是灵活性和便利性，但是你需要注意他们的教学质量和证书的认可度。

在选择办理按摩理疗师证的部门时，你应该根据你的个人需求和目标进行权衡，如果你希望在一个特定的地区工作，那么选择那个地区的培训和证书颁发机构可能会更有帮助，你也应该对各个机构的课程内容、费用、教师资质等信息进行详细的研究，以确保你能够获得高质量的教育和证书。