中医针灸师证办理机构主要分为两类：一类是公立医院，另一类是私立培训机构，以下是一些具体的办理机构：

1、公立医院：许多公立医院都设有中医科，并且有专门的针灸师培训和考核机制，北京中医药大学东方医院、上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院等，这些医院的针灸师证办理流程一般为：报名参加培训→完成培训并通过考试→领取证书，需要注意的是，不同地区的公立医院具体办理流程可能会有所不同，请以当地医院为准。

2、私立培训机构：随着中医针灸在国内外的普及，越来越多的私立培训机构开始提供中医针灸师证培训课程，这些机构通常会与公立医院合作，共同开展培训和考核工作，北京中医学研究院、上海华夏中医药发展基金会等，这些机构的针灸师证办理流程一般为：报名参加培训→完成培训并通过考试→领取证书，需要注意的是，选择私立培训机构时一定要注意其资质和信誉，避免上当受骗。

3、其他相关单位：除了上述两种主要类型的办理机构外，还有一些其他相关单位也可以提供中医针灸师证办理服务，国家中医药管理局、各省市中医药管理部门等，这些单位通常会发布相关的政策法规和考试信息，方便有意从事中医针灸工作的人员了解和申请。

中医针灸师证办理机构有很多种，具体选择哪种机构需要根据个人需求和实际情况来决定，在选择办理机构时，一定要注意核实其资质和信誉，确保所获得的证书具有法律效力和行业认可度，还需要关注相关的政策法规和考试动态，不断提高自己的业务水平和综合素质。