高级针灸师证是国家承认的专业资格证书，持有该证书的人员在医疗单位工作是可以的，根据《中华人民共和国医师法》和《针灸师执业管理规定》，针灸师可以在医疗机构、中医诊所、康复机构等地方从事针灸诊疗工作，而高级针灸师则是在具备一定的临床经验和技术水平的基础上，通过国家统一组织的高级针灸师资格考试获得的。

在医疗单位工作的高级针灸师，其工资水平主要由以下几个因素决定：

1、所在地区：不同地区的经济发展水平和消费水平不同，因此高级针灸师的工资也会有所差异，一线城市的工资水平会高于二三线城市。

2、医疗单位性质：不同的医疗单位性质不同，例如公立医院、私立医院、中医诊所等，其对高级针灸师的待遇也会有所不同，公立医院的工资水平会高于私立医院。

3、个人经验和技术水平：高级针灸师的工资水平与其个人的经验和技术水平密切相关，具有丰富临床经验和技术水平的高级针灸师，其工资水平会相对较高。

4、职称评定：在医疗单位工作期间，高级针灸师还可以通过职称评定来提高自己的工资水平，通过评定为副主任医师、主任医师等职称，可以获得相应的工资待遇提升。

综合来看，持有高级针灸师证书的医务人员在医疗单位工作的工资水平一般是比较稳定的，根据不同地区、医疗单位性质以及个人经验和技术水平等因素的不同，其工资水平可能在5000元至2万元之间波动，需要注意的是，具体的工资数额还需要根据实际情况进行具体分析。