康复理疗师证办理机构的部门设置和职责划分对于保证康复理疗师证的质量和有效性具有重要意义，康复理疗师证办理涉及的部门主要包括以下几个：

人力资源与社会保障部门 :这是康复理疗师证办理的基本部门，负责制定和执行康复理疗师证的颁发政策，包括证书的申请、审核、发放等环节，他们还会对康复理疗师的专业能力进行评估，以确保康复理疗师具备相应的专业知识和技能。

卫生健康委员会 :作为康复理疗服务的主要提供者，卫生健康委员会在康复理疗师证的办理中也扮演着重要角色，他们会参与到康复理疗师的资格审核中，确保康复理疗师的服务符合相关的健康和医疗标准。

职业技能鉴定中心 :这个部门负责组织和实施康复理疗师的专业技能考核，包括理论知识和实践操作两个部分，通过考核，可以准确评估康复理疗师的专业能力，为颁发证书提供依据。

培训机构和学校 :这些机构负责培训康复理疗师，提供必要的教学资源和实践机会，他们的教学质量和服务水平直接影响到康复理疗师证的质量。

行业协会或组织 :一些行业协会或组织也会参与到康复理疗师证的办理中，他们会制定行业标准和规范，监督康复理疗师的专业行为，维护行业的秩序和公正。