中医针灸理疗师证书是由多个国家和地区的专业机构颁发的，在中国，中医针灸理疗师证书主要由各省、自治区、直辖市的中医药管理部门颁发，这些部门通常设有专门的中医药考试机构，负责组织和管理中医针灸理疗师的培训、考试和证书颁发工作。

在国际上，也有一些权威的针灸理疗师培训机构和认证机构，如美国针灸医学院(Acupuncturist Board of California, ABC)、英国皇家针灸医学院(Royal College of Acupuncture and Chinese Medicine, RCAM)、澳大利亚针灸与康复治疗师委员会(Australian Council on Therapeutic Massage and Acupuncture, ACTMA)等，这些机构通常会对学员进行严格的培训和考核，确保其具备足够的专业技能和知识，然后颁发相应的针灸理疗师证书。

还有一些非政府组织和行业协会也会颁发针灸理疗师证书，如世界针灸联合会(World Federation of Acupressure, WFA)、国际针灸协会(International Association of Acupressure, IAA)等，这些组织通常会要求学员参加一定的培训课程和实践操作，以证明其具备相关的专业能力。

中医针灸理疗师证书的颁发机构有很多，包括中国国内的中医药管理部门、国际上的权威针灸理疗师培训机构和认证机构，以及一些非政府组织和行业协会，在选择针灸理疗师证书时，建议考生充分了解各个机构的背景、资质和声誉，以便做出明智的决策，也要注意查看证书上是否注明了发证机构的名称和编号，以确保证书的真实性和有效性。