物流管理师证书考试的科目包括理论知识部分和技能操作部分，理论知识部分包括物流概述、物流运行系统、物流管理系统、物流装备与标准化、物流相关法律法规、职业道德；技能操作部分包括物品采购、仓储管理、配送管理、运输管理、生产物流管理、国际物运管理、物流信息管理和物流英语 。