康复理疗师证发证机关是指负责颁发康复理疗师资格证书的政府部门或机构，在中国，康复理疗师证发证机关通常为卫生健康委员会、人力资源和社会保障局等相关部门。

填写康复理疗师证发证机关时，需要根据自己所在地区的实际情况进行选择，可以在相关政府部门的官方网站上查询到具体的发证机关名称和地址，如果在北京市申请康复理疗师证书，可以登录北京市卫生健康委员会官网查询相关信息。

在填写康复理疗师证发证机关时，需要填写完整的单位名称、地址、电话等信息，并加盖单位公章，还需要提供个人身份证明、学历证明等相关材料。

需要注意的是，不同地区对于康复理疗师证书的要求可能会有所不同，因此在申请前最好先了解当地的相关规定和要求，获得康复理疗师证书后，还需要不断学习和提高自己的专业技能，以更好地服务于患者和社会。