康复理疗师证是指在医疗机构、康复中心、养老院等场所从事康复理疗工作的专业人员所取得的资格证书，根据不同国家和地区的法规，办理康复理疗师证的具体部门和流程可能会有所不同，在中国，康复理疗师证的办理主要由以下几个部门负责：

1、卫生健康委员会：卫生健康委员会是负责全国卫生和健康事业的主管部门，其下设有职业卫生和放射卫生监督所、医疗卫生监督管理局等部门，康复理疗师证的办理需要向这些部门提交相关材料，经过审核后方可获得证书。

2、人力资源和社会保障部：人力资源和社会保障部是负责全国人力资源和社会保障工作的主管部门，其下设有职业技能鉴定中心、职业培训中心等部门，康复理疗师证的办理也需要向这些部门提交相关材料，经过职业技能鉴定并通过培训后，方可获得证书。

3、国家中医药管理局：国家中医药管理局是负责全国中医药事业的主管部门，其下设有中医药管理处、中医医政司等部门，在一些地区，康复理疗师证的办理还需要向这些部门提交相关材料，经过审核后方可获得证书。

4、地方卫生健康委员会：在省、市、县级行政区域内，卫生健康委员会也承担着康复理疗师证的办理工作，具体办理流程和所需材料可能因地区而异，一般需要向当地卫生健康委员会咨询并按照要求提交相关材料。

5、其他相关部门：在一些特殊情况下，如军队、武警部队等单位需要康复理疗师，可能还需要向其他相关部门提交材料并进行特殊审批。

办理康复理疗师证需要向多个部门提交相关材料，并经过严格的审核和培训，具体办理流程和所需材料可能因地区和单位而异，建议提前向当地卫生健康委员会或相关部门咨询了解详细信息。