健康管理师证机构是指那些经过国家相关部门批准，具有颁发健康管理师证书资格的机构，这些机构通常包括教育部门、卫生健康部门、职业技能鉴定部门等，在中国，健康管理师证机构的主要部门有以下几个：

1、国家卫生健康委员会(简称卫健委):作为中国政府部门的重要组成部分，卫健委负责制定和实施卫生健康政策、法规和标准，对全国卫生工作进行指导和监督，卫健委下设多个司局，其中包括职业卫生与放射卫生司，负责职业健康检查、职业病诊断与鉴定等工作，这为健康管理师证的颁发提供了政策支持。

2、教育部：教育部负责全国教育工作的领导和管理，包括高等教育、职业教育、成人教育等，教育部下设职业教育与成人教育司，负责职业教育和成人教育的政策制定、监督管理等工作，健康管理师作为职业教育的一种，得到了教育部的重视和支持。

3、人力资源和社会保障部：人力资源和社会保障部负责全国人力资源和社会保障工作的领导和管理，包括职业培训、职业技能鉴定、劳动关系处理等，人社部下设职业技能鉴定中心，负责职业技能鉴定工作的组织和管理，为健康管理师证的颁发提供了技术支持。

4、国家市场监督管理总局：国家市场监督管理总局负责全国市场监管工作的领导和管理，包括产品质量安全、食品药品监管等，市场监管总局下设认证认可监管司，负责认证认可工作的监督管理，为健康管理师证的颁发提供了权威保障。

5、中国职业技能鉴定中心：中国职业技能鉴定中心是国家职业技能鉴定工作的主管部门，负责组织和管理全国职业技能鉴定工作，该中心设有健康管理师职业技能鉴定考试，对参加考试并合格的人员颁发健康管理师证书。

6、其他相关行业协会和机构：如中国健康管理协会、中国保健营养协会等，这些协会和机构在健康管理师证的培训、考试、认证等方面发挥着重要作用。

健康管理师证机构涉及多个部门和机构，共同构成了一个完善的颁发和管理健康管理师证书的体系，在这个体系下，广大从事健康管理工作的人员可以通过参加培训、考试等途径，获得健康管理师证书，提高自己的专业素养和竞争力。