在中国，针灸理疗师证的颁发主要由两个机构进行：中国中医科学院和各省、自治区、直辖市的中医药管理部门，这两个机构都是在国家卫生健康委员会的指导下，具有权威性和公信力。

中国中医科学院是中国最高学术机构和全国中医药科研、教育、医疗、预防、康复为一体的综合性研究机构，它的针灸学科有着深厚的历史积淀和丰富的实践经验，其颁发的针灸理疗师证被业界广泛认可，由于其专业性较强，普通公众可能较难获取此证书。

各省、自治区、直辖市的中医药管理部门则负责本地区的中医药管理工作，包括针灸理疗师的培训、考核和证书颁发，这些机构通常会与当地的中医药大学或职业技术学校合作，进行系统的针灸理疗师培训，虽然这些证书在地方上具有一定的权威性，但在全国范围内的认可度可能会稍低。

如果你希望获得全国范围内通用的针灸理疗师证书，那么中国中医科学院的证书可能是更好的选择，而如果你只是需要在本地使用这个证书，那么各省、自治区、直辖市的中医药管理部门颁发的证书也是可以接受的，无论选择哪个机构颁发的证书，都建议你深入了解相关的培训课程和考试内容，确保自己具备足够的专业知识和技能，才能胜任针灸理疗师的工作。