康复理疗师证是一种专业资格证书，主要用于证明持有人具备一定的康复理疗知识和技能，在不同的国家和地区，办理康复理疗师证的具体部门和流程可能会有所不同，在中国，康复理疗师证的办理主要由以下几个部门负责：

1、卫生健康委员会：卫生健康委员会是负责全国卫生和健康事业的主管部门，其下设有多个局和处，如卫生监督局、中医药管理局等，在这些局和处中，有一些负责职业资格认证工作，康复理疗师证的办理也属于其中之一。

2、人力资源和社会保障部：人力资源和社会保障部是负责全国人力资源和社会保障工作的主管部门，其下设有多个司和局，如劳动保障司、职业技能鉴定中心等，在这些司和局中，也有一些负责职业资格认证工作，康复理疗师证的办理也属于其中之一。

3、国家卫生健康委员会：国家卫生健康委员会是负责全国卫生健康工作的主管部门，其下设有多个局和处，如卫生发展研究中心、卫生人才交流服务中心等，在这些局和处中，也有一些负责职业资格认证工作，康复理疗师证的办理也属于其中之一。

4、地方卫生健康委员会：各省、自治区、直辖市的卫生健康委员会负责本行政区域内的卫生健康工作，其中也包括康复理疗师证的办理，具体办理部门可能因地区而异，一般可以在当地的卫生健康委员会或其指定的机构进行咨询和办理。

5、培训机构：除了政府部门外，还有一些专门从事职业技能培训的机构，如职业技能培训学校、职业培训机构等，这些机构也可以为学员提供康复理疗师证的培训和考试服务。

康复理疗师证的办理需要在相关部门进行，具体办理部门可能因国家和地区而异，建议您在办理前先了解所在国家或地区的相关规定，以便顺利完成证书的申领，您还可以向当地的卫生健康委员会、人力资源和社会保障部等相关部门咨询具体的办理流程和要求，以确保您的申请能够顺利进行。