针灸理疗师证是国家职业资格证书，可以在医疗机构使用，根据《中华人民共和国职业资格证书条例》规定，职业资格证书是从事相应职业的必备证明，具有法律效力，持有针灸理疗师证的人员可以在医疗机构从事相应的工作。

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