按摩理疗师证的办理部门通常是由卫生健康委员会、人力资源和社会保障局等相关部门共同负责，不同地区和国家的管理部门可能有所不同，因此在办理按摩理疗师证时，需要先了解所在地的具体规定。

在中国，按摩理疗师证的办理主要分为以下几个步骤：

1、培训：首先需要参加由卫生部门批准的按摩培训机构进行培训，学习相关的理论知识和实践技能，培训时间一般为40-60小时，包括中医基础理论、按摩手法、常见疾病按摩等内容。

2、考试：培训结束后，需要参加由当地卫生健康委员会组织的按摩理疗师职业资格考试，考试内容包括理论知识和实践操作两部分，考试形式为笔试和实际操作考核，考试合格后，方可获得按摩理疗师资格证书。

3、申请：取得按摩理疗师资格证书后，可以向当地人力资源和社会保障局申请领取按摩理疗师证，申请时需要提供相关材料，如身份证、学历证明、培训证书、考试成绩单等。

4、注册：在申请成功后，还需要在所在地区的卫生健康委员会进行备案登记，完成按摩理疗师证的注册手续，注册后的按摩理疗师方可在医疗机构、保健机构等场所从事按摩理疗工作。

需要注意的是，不同国家和地区的按摩理疗师证办理流程可能有所不同，因此在办理过程中，务必遵循当地的法律法规和相关规定，为了提高自己的专业素质和竞争力，建议按摩理疗师在取得证书后，不断学习和进修，提升自己的业务水平。