心理咨询师证书是由国家相关部门发放的，主要是由国家卫生健康委员会（原卫生部）和国家职业资格认证中心共同负责，这两个部门在心理咨询师培训、考核和证书发放方面有着严格的管理和监督职责，以确保心理咨询师的专业素质和服务质量。

国家卫生健康委员会（原卫生部）是中国政府主管卫生和健康工作的部门，其主要职责包括制定卫生政策、法规和标准，组织实施卫生规划，监督管理医疗卫生服务，以及开展健康教育和健康促进工作等，在心理咨询领域，国家卫生健康委员会主要负责制定心理咨询师的职业标准和培训大纲，对心理咨询师的培训和考核进行指导和监督。

国家职业资格认证中心是国家卫生健康委员会下属的一个专门负责职业资格认证的机构，其主要职责是对各类专业技术人员的职业资格进行认证和管理，在心理咨询师证书发放方面，国家职业资格认证中心主要负责组织心理咨询师的考试和评审工作，以及对通过考试的心理咨询师颁发证书。

为了确保心理咨询师的专业素质和服务质量，国家卫生健康委员会和国家职业资格认证中心在心理咨询师培训、考核和证书发放方面制定了严格的标准和程序，心理咨询师需要接受系统的培训，学习心理学、心理咨询理论和技术，以及相关法律法规和职业道德等内容，培训课程通常包括基础理论课程、实践操作课程和实习实训等环节，以确保心理咨询师具备扎实的理论基础和实际操作能力。

心理咨询师需要参加由国家职业资格认证中心组织的考试，考试内容主要包括心理学基础知识、心理咨询理论和技术、法律法规和职业道德等方面，考试形式通常为笔试和面试相结合，以全面评估心理咨询师的专业素质和服务能力。

通过考试的心理咨询师需要提交相关材料，如培训证明、实习报告等，由国家职业资格认证中心进行评审，评审通过后，心理咨询师将获得由国家卫生健康委员会和国家职业资格认证中心共同颁发的心理咨询师证书，该证书具有法定效力，是心理咨询师从事专业工作的必备证件。

心理咨询师证书是由国家卫生健康委员会和国家职业资格认证中心共同发放的，这两个部门在心理咨询师培训、考核和证书发放方面有着严格的管理和监督职责，以确保心理咨询师的专业素质和服务质量。