营养土登记证的办理手续主要包括以下几个步骤：

1、了解相关政策和法规：在办理营养土登记证之前，首先要了解国家和地方政府关于土壤肥料管理的相关政策、法规和标准，这些政策、法规和标准是指导企业和个人合理利用土壤资源、保护生态环境、促进农业可持续发展的重要依据。

2、准备相关材料：根据当地农业部门的要求，准备好办理营养土登记证所需的材料，这些材料通常包括：企业或个人的营业执照、组织机构代码证、税务登记证等基本证明材料；土壤样品分析报告；营养土生产工艺及配方；营养土产品说明书等。

3、提交申请：将准备好的材料提交给当地农业部门，申请办理营养土登记证，在提交申请时，要注意填写申请表，确保信息准确无误。

4、接受现场检查：农业部门收到申请后，会对申请企业或个人进行现场检查，现场检查主要是对生产设施、生产工艺、产品质量等方面进行检查，以确保申请企业或个人具备生产合格营养土的能力。

5、审核评估：农业部门会根据现场检查结果，对企业或个人的生产能力、产品质量、环保措施等方面进行审核评估，审核评估通过后，农业部门会出具营养土登记证。

6、领取证书：企业或个人在审核评估通过后，可以到农业部门领取营养土登记证，领取证书时，要携带有效身份证件，以便核实身份。

7、定期报告：获得营养土登记证的企业或个人，需要按照农业部门的要求，定期报告生产情况、产品质量、环保措施等方面的信息，这些信息将作为农业部门对企业或个人进行监管的依据。

8、遵守法律法规：获得营养土登记证的企业或个人，要严格遵守国家和地方政府关于土壤肥料管理的法律法规，确保生产活动合法合规，要不断提高产品质量，加强环保措施，为农业可持续发展做出贡献。

办理营养土登记证需要遵循一定的程序，按照规定准备相关材料，接受现场检查和审核评估，获得营养土登记证后，企业或个人要遵守法律法规，定期报告生产情况，确保生产活动合法合规，通过办理营养土登记证，企业和个人可以提高自身信誉，为农业可持续发展做出贡献。