心理咨询师证书是由国家相关部门发放的，用于证明持证人具备从事心理咨询工作的资格和能力，在中国，心理咨询师证书的发放主要由以下几个部门负责：

1、国家卫生健康委员会（National Health Commission，简称NHC）：作为国家卫生和健康领域的最高行政机构，国家卫生健康委员会负责制定和实施心理咨询行业的相关政策、法规和标准，该委员会还负责对心理咨询师进行培训、考核和认证。

2、中国心理卫生协会（China Association for Mental Health，简称CAMH）：中国心理卫生协会是全国性的专业学术团体，主要负责组织和开展心理咨询师的培训、考核和认证工作，协会下设心理咨询师专业委员会，负责制定心理咨询师的培训大纲、考核标准和认证程序。

3、各省市卫生健康委员会（Health Commission）：在国家卫生健康委员会的指导下，各省市卫生健康委员会负责本行政区域内心理咨询师的培训、考核和认证工作，具体工作包括组织实施心理咨询师的培训课程、组织考试和评审、颁发证书等。

4、专业培训机构：除了国家和地方卫生健康部门外，还有一些专业的心理咨询师培训机构，如心理学院校、心理咨询中心等，也提供心理咨询师的培训、考核和认证服务，这些机构通常会与国家和地方卫生健康部门合作，共同推进心理咨询师的培养和发展。

5、国际认证机构：随着国际交流的不断加强，一些国际知名的心理咨询师认证机构，如美国心理学会（American Psychological Association，简称APA）、英国皇家心理协会（Royal College of Psychiatrists，简称RCPsych）等，也开始在中国开展心理咨询师的培训和认证工作，这些机构的认证证书在全球范围内具有较高的权威性和认可度。

心理咨询师证书的发放是一个涉及多个部门和机构的复杂过程，申请人需要参加由国家或地方卫生健康部门、专业培训机构或国际认证机构组织的培训课程，通过考试和评审后，才能获得心理咨询师证书，持证人还需要定期参加继续教育，以更新知识和技能，保持证书的有效性。