健康管理师证书被废除的原因有以下几点：

1、行业监管不力：在健康管理师证书颁发过程中，监管部门对培训机构和从业人员的资质把关不严，导致市场上出现大量不合格的健康管理师，这些不合格的人员为公众提供了错误的健康观念和指导，损害了消费者的利益。

2、缺乏统一的标准和规范：健康管理师证书的考核内容和标准不一，导致培训质量参差不齐，由于缺乏统一的管理规定，健康管理师的职责和权限也不明确，容易导致滥用职权和不负责任的行为。

3、过度商业化：随着健康产业的快速发展，一些培训机构和企业为了追求利润，过度强调健康管理师的市场需求，忽视了人才培养的质量，这导致了大量的“速成”健康管理师进入市场，降低了整个行业的专业水平。

4、社会认识偏差：部分人对健康管理师的认识存在误区，认为只要拿到证书就可以从事健康管理工作，这种观念使得一些没有专业知识和技能的人员也进入了健康管理行业，影响了整个行业的声誉和发展。

5、人才断层：由于健康管理师证书被废除，一些原本从事这一行业的人员失去了工作和收入来源，导致人才断层，这对于行业的发展和稳定造成了一定的影响。

健康管理师证书被废除的原因主要是行业监管不力、缺乏统一的标准和规范、过度商业化、社会认识偏差以及人才断层等，为了保障公众的权益和提高整个行业的发展水平，有关部门应加强对健康管理行业的监管，制定统一的标准和规范，引导培训机构和企业走向专业化、正规化的发展道路，加强公众的健康教育，提高人们对健康管理的认识和需求，从而促进健康管理行业的健康发展。