健康管理师证发证机关是指负责管理和监督健康管理师职业资格认证的政府部门或机构，在中国，健康管理师证发证机关主要由国家卫生健康委员会(原卫生部)和各省、自治区、直辖市卫生健康委员会共同承担，还有一些行业协会和专业机构负责健康管理师的培训、考试和认证工作。

国家卫生健康委员会(原卫生部)是健康管理师证发证机关的重要组成部分，该部门负责制定和管理健康管理师的职业资格标准，组织实施全国范围内的健康管理师考试和认证工作，国家卫生健康委员会还负责对健康管理师的职业行为进行监管，确保健康管理师能够遵守职业道德规范，为人民群众提供优质的健康服务。

各省、自治区、直辖市卫生健康委员会在地方层面上负责健康管理师证的发放和管理，各级卫生健康委员会根据国家卫生健康委员会的统一要求，组织开展本地区健康管理师的考试、认证和管理工作，各级卫生健康委员会还负责对本地区健康管理师的职业发展进行指导和培训，提高健康管理师的专业素质和服务水平。

除了政府部门外，还有一些行业协会和专业机构参与到健康管理师证发证工作中，中国保健协会、中国医疗保健国际交流促进会等组织，通过开展健康管理师的培训、考试和认证工作，推动健康管理师行业的规范化和专业化发展，这些协会和机构在健康管理师证发证工作中发挥着积极的作用，为广大健康管理师提供了一个公平、公正的竞争平台。

健康管理师证发证机关是一个涉及多个政府部门、行业协会和专业机构的综合性管理体系，在这个体系中，各方共同努力，确保健康管理师的职业资格得到有效认证，为广大人民群众提供更加优质、专业的健康服务。