根据我所了解的信息，环境监理工程师证书并没有被取消，随着我国环境保护政策的不断调整和优化，环境监理工程师的职责和工作范围也在发生变化，为了更好地适应新的形势和任务，相关部门对环境监理工程师的职业资格进行了改革和调整。

目前，环境监理工程师仍然可以通过正规途径办理，具体的办理流程如下：

1、报名参加环境监理工程师职业资格考试，考生需要在规定的时间内通过中国人事考试网进行报名，并按照要求缴纳考试费用。

2、参加环境监理工程师职业资格考试，考生需要按照准考证上的时间和地点参加笔试，笔试主要测试考生的基本知识和技能，包括环境法律法规、环境影响评价、环境监理实务等方面的内容。

3、通过笔试后，考生可以参加环境监理工程师职业资格考试的面试环节，面试主要测试考生的综合分析能力、沟通能力和解决问题的能力等。

4、考试合格后，考生可以在规定的时间内到当地的人力资源和社会保障局领取环境监理工程师职业资格证书。

需要注意的是，办理环境监理工程师证书的过程中，考生需要遵守相关的规定和要求，如按时参加考试、诚信应试等，考生还需要关注国家和地方政府关于环保政策的最新动态，不断提高自己的业务水平和综合素质。