健康管理师证书的发放部门因国家和地区的法规政策而异，在某些国家，例如美国，健康管理师证书由相关行业的认证机构发放；在其他国家，如中国，健康管理师证书则由人力资源和社会保障部门颁发。

在中国，健康管理师证书的发放主要由人力资源和社会保障部门负责，这些部门通常包括国家卫生健康委员会、各省市人力资源和社会保障局等，这些部门会根据国家卫生健康委员会制定的健康管理师职业技能标准和培训要求，对参加培训并通过考试的人员进行资格审核，最后颁发相应的健康管理师证书。

为了获得健康管理师证书，考生需要参加由相关部门组织的培训课程，学习健康管理的基本理论、技能和方法，在完成培训课程并通过考试后，考生可以向相关部门申请颁发健康管理师证书，健康管理师证书还有一定的有效期，过期后需要重新参加培训和考试以更新证书。

健康管理师证书的发放部门因国家和地区的法规政策而异，但在中国主要是由人力资源和社会保障部门负责，考生需要参加相关培训课程并通过考试，才能获得健康管理师证书。