针灸师从业资格证的颁发主要由国家卫生健康委员会负责，各省、自治区、直辖市卫生健康委员会以及军队卫生部门协助进行，具体的颁发机构包括以下几个方面：

1、国家卫生健康委员会：作为最高卫生行政管理机构，国家卫生健康委员会负责制定和发布针灸师从业资格证的相关政策、法规和标准，对全国范围内的针灸师从业资格证颁发工作进行统一管理和监督。

2、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会：各省、自治区、直辖市卫生健康委员会在国家卫生健康委员会的指导下，负责本辖区内针灸师从业资格证的颁发工作，各级卫生健康委员会会同人力资源社会保障部门共同组织实施针灸师从业资格考试，对考试合格者进行资格审核，并颁发相应的针灸师从业资格证。

3、军队卫生部门：军队卫生部门同样负责针灸师从业资格证的颁发工作，军队卫生部门会同地方卫生健康部门共同组织实施针灸师从业资格考试，对考试合格者进行资格审核，并颁发相应的针灸师从业资格证。

4、中医药行业组织：如中国中医科学院、中华中医药学会等，这些组织在国家卫生健康委员会的指导下，负责组织和推动针灸师从业资格证的培训、考试和颁发工作，提高针灸师的专业水平和服务质量。

5、社会培训机构：一些专业的社会培训机构也会参与针灸师从业资格证的培训和考试工作，为有意向从事针灸行业的人员提供专业的培训和学习机会。

针灸师从业资格证的颁发涉及多个部门和机构，需要各方共同努力，确保针灸师这一职业能够得到规范、专业的发展，考生在报名参加针灸师从业资格考试时，应选择正规的报名渠道和培训机构，以确保自己的权益得到保障。