文物鉴定师证书是由国家文物局颁发的，国家文物局是中国政府的一个部门，负责管理和保护中国的文物，根据《中华人民共和国文物保护法》和《文物鉴定管理办法》，经考试合格的人员，由国家文物局颁发相应的文物鉴定师证书。

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