中医针灸师证办理机构主要包括以下几个单位：

1、中医药管理部门：中医药管理部门是负责中医针灸师证书颁发的主管部门，各级中医药管理部门根据国家有关规定，负责中医针灸师的资格认证、考试、培训等工作，在中医药管理部门工作的人员需要具备一定的专业知识和技能，以确保中医针灸师证书的权威性和有效性。

2、中医药院校：中医药院校是培养中医针灸师的主要基地，这些院校通常设有针灸推拿专业，为学生提供系统的理论知识和实践技能培训，在完成学业并通过考试的学生将获得中医针灸师证书，成为合格的中医针灸师。

3、医疗机构：医疗机构是中医针灸师执业的主要场所，在医疗机构工作的中医针灸师需要具备丰富的临床经验和良好的沟通能力，以便为患者提供专业的针灸治疗服务，医疗机构会定期组织中医针灸师参加培训和考核，以确保其业务水平和服务质量。

4、行业协会：行业协会是中医针灸师行业的自律组织，行业协会通常会组织各类培训、交流活动，提高中医针灸师的专业素养和服务水平，行业协会还会协助中医药管理部门对中医针灸师行业进行监管，维护行业秩序。

5、培训机构：培训机构是为中医针灸师提供专业培训和技能提升服务的机构，这些培训机构通常由具有丰富教学经验和专业知识的教师授课，帮助学员掌握中医针灸的核心理论和实践技能，通过培训和考试合格的学员将获得中医针灸师证书，提高个人竞争力。

6、考证辅导机构：考证辅导机构是为考生提供考试辅导和指导服务的机构，这些机构通常会针对中医针灸师证考试的特点和要求，制定相应的培训课程和辅导资料，帮助考生提高考试通过率。

中医针灸师证办理涉及多个部门和单位的协同合作，共同保障中医针灸师证书的权威性和有效性，希望以上内容能够帮助您了解中医针灸师证办理的相关单位和流程。