中医康复理疗师证书的颁发部门主要有两个，分别是国家卫生健康委员会和人力资源和社会保障部，这两个部门都是我国政府部门，分别负责我国卫生健康和人力资源方面的管理工作。

国家卫生健康委员会(简称国家卫健委)是中华人民共和国国务院组成部门，主要负责制定和实施卫生健康政策、法规、标准，以及疾病预防控制、健康教育等工作，国家卫健委下设多个局和司，其中就包括中医药管理局，负责全国中医药事业的发展和管理。

人力资源和社会保障部(简称人社部)是中华人民共和国国务院组成部门，主要负责制定和实施人力资源社会保障政策、法规、标准，以及劳动关系协调、职业培训、社会保险等工作，人社部下设多个司和局，其中就包括职业技能鉴定司，负责职业技能鉴定工作的组织和管理。

中医康复理疗师证书的颁发需要经过国家卫生健康委员会和人力资源和社会保障部的共同审核和批准，在考试合格的基础上，学员还需要参加一定的实践培训，并通过实践考核，只有具备一定的理论知识和实践能力，才能获得中医康复理疗师证书。

中医康复理疗师证书的颁发部门主要有两个，分别是国家卫生健康委员会和人力资源和社会保障部，这两个部门都是我国政府部门，分别负责我国卫生健康和人力资源方面的管理工作，在这两个部门的共同审核和批准下，学员才能获得中医康复理疗师证书。