康复理疗师证颁发部门主要由卫生部、人力资源和社会保障部、国家中医药管理局等部门共同负责，卫生部负责制定康复理疗师的职业标准和培训大纲，组织实施康复理疗师的职业技能鉴定工作；人力资源和社会保障部负责将康复理疗师纳入国家职业资格证书制度，统一管理和监督；国家中医药管理局则负责对康复理疗师进行中医药方面的专业培训和指导。

各省、自治区、直辖市也设有专门的康复理疗师证颁发部门，负责本地区的康复理疗师证书颁发和管理，这些部门通常包括卫生健康委员会、人力资源和社会保障局、中医药管理局等，在这些部门的指导下，各级医疗卫生机构、职业技术学校、职业技能培训机构等单位都承担着康复理疗师的培训和考核工作。

在康复理疗师证颁发过程中，各地区还会根据实际情况制定相应的考试大纲和标准，以确保康复理疗师的专业素质和技能水平得到有效提升，为了保证康复理疗师队伍的整体素质，相关部门还会定期对康复理疗师进行业务培训和考核，以确保其专业技能的持续更新和发展。

康复理疗师证颁发部门主要包括卫生部、人力资源和社会保障部、国家中医药管理局等部门，以及各省、自治区、直辖市的康复理疗师证颁发部门，这些部门共同负责康复理疗师的职业培训、考核、证书颁发和管理工作，以确保康复理疗师的专业素质和技能水平得到有效提升。