针灸理疗师证书颁发机构是负责对针灸理疗师进行专业培训、考核和认证的权威机构，在中国，针灸理疗师证书的颁发主要由以下几个单位负责：

1、国家卫生健康委员会(National Health Commission of the People's Republic of China,简称NHC):作为中国政府的最高卫生监管机构，NHC负责制定和发布针灸理疗行业的政策法规，对针灸理疗师的培训和认证工作进行监督和管理。

2、中国中医科学院针灸研究所(Chinese Academy of Chinese Medical Sciences,简称CACMS):中国中医科学院针灸研究所是中国针灸理论研究和实践的重要基地，负责组织和开展针灸理疗师的专业培训和考核工作。

3、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会：各级卫生健康委员会在NHC的指导下，负责本行政区域内针灸理疗师的培训、考核和证书颁发工作，各地可以根据实际情况，与相关医疗机构合作，共同开展针灸理疗师的培训和认证工作。

4、中医药行业职业资格鉴定中心：中医药行业职业资格鉴定中心是经国家人力资源和社会保障部批准设立的，负责中医药行业职业技能鉴定工作的机构，针灸理疗师证书的颁发工作也受到其监督和管理。

5、部分社会培训机构：为了满足市场需求，一些专业的社会培训机构也提供针灸理疗师培训课程，学员完成培训并通过考核后，可以获得由上述单位颁发的针灸理疗师证书。

针灸理疗师证书的颁发机构主要包括国家卫生健康委员会、中国中医科学院针灸研究所、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会以及中医药行业职业资格鉴定中心等，这些单位共同确保了针灸理疗师的专业素质和技能水平，为广大患者提供优质的针灸治疗服务。