中医康复理疗师证的颁发部门有很多，其中包括国家卫生健康委员会、中医药管理局、人力资源和社会保障部等，不同的部门对于中医康复理疗师证书的颁发有着不同的要求和标准，因此在选择颁发部门时需要根据自己的实际情况进行综合考虑。

国家卫生健康委员会是国家级的卫生行政部门，负责全国卫生计生工作的领导和管理，该部门颁发的中医康复理疗师证书具有权威性和认可度较高，可以在国内范围内得到广泛认可，国家卫生健康委员会还会定期组织中医康复理疗师的培训和考试，为学员提供了一个良好的学习和交流平台。

中医药管理局也是国家级的卫生行政部门之一，主要负责中医药事业的发展和管理，该部门颁发的中医康复理疗师证书同样具有较高的权威性和认可度，可以在国内范围内得到广泛认可，中医药管理局还会定期组织中医康复理疗师的培训和考试，为学员提供了一个良好的学习和交流平台。

人力资源和社会保障部是国家级的人力资源和社会保障部门，负责全国人力资源和社会保障工作的领导和管理，该部门颁发的中医康复理疗师证书同样具有较高的权威性和认可度，可以在国内范围内得到广泛认可，人力资源和社会保障部还会定期组织中医康复理疗师的培训和考试，为学员提供了一个良好的学习和交流平台。

中医康复理疗师证哪个部门颁发的好并没有一个固定的答案，不同部门的颁发标准和要求不同，需要根据自己的实际情况进行综合考虑，无论选择哪个部门颁发的证书，都需要具备一定的专业知识和技能才能胜任相关工作。