中医康复理疗师证书的机构有很多，以下是一些比较知名的机构：

1、国家中医药管理局职业技能鉴定所

2、北京市中医药学会中医康复专业委员会

3、上海市中医药学会中医康复专业委员会

4、广东省中医药学会中医康复专业委员会

5、天津市中医药学会中医康复专业委员会

6、重庆市中医药学会中医康复专业委员会

7、四川省中医药学会中医康复专业委员会

8、湖南省中医药学会中医康复专业委员会

9、山东省中医药学会中医康复专业委员会

10、河南省中医药学会中医康复专业委员会