运动康复师证发证机构是由国家卫生健康委员会(National Health Commission of the People's Republic of China,简称NHC)负责的，NHC是中华人民共和国国务院的组成部门，主要负责制定和实施卫生政策、法规和标准，以及监督和管理卫生工作。

在NHC的下属部门中，有一个专门负责职业资格认证工作的部门，名为国家卫生健康委员会职业技能鉴定中心(以下简称“职鉴中心”)，职鉴中心负责全国范围内的职业技能鉴定工作，包括运动康复师的职业资格证书颁发。

运动康复师证的考试和发放工作主要由职鉴中心负责，考生需要通过职鉴中心组织的考试，考试合格后，方可获得运动康复师证书，职鉴中心会将考试成绩报送给NHC,由NHC决定是否颁发证书。

各省级卫生健康行政部门也有责任在本行政区域内组织运动康复师的考试和证书发放工作，在一些地区，职鉴中心和省级卫生健康行政部门会共同负责运动康复师证的颁发工作。

运动康复师证发证机构是由国家卫生健康委员会(NHC)及其下属的职业技能鉴定中心(职鉴中心)负责的，在考取运动康复师证书的过程中，考生需要遵循国家和地方的相关政策法规，通过职鉴中心组织的考试，才能获得运动康复师证书。