高级农艺师证书发证机关的填写需要根据实际情况来确定，可以填写以下几个方面的内容：

1、所在单位名称：填写您所在的农业技术推广部门、农业科研院所、农业企业等单位名称。

2、证书级别：填写高级农艺师证书。

3、证书编号：填写颁发给您的高级农艺师证书编号。

4、发证日期：填写颁发高级农艺师证书的日期。

5、发证机关：填写颁发高级农艺师证书的机关名称，一般为省级以上农业主管部门或者国家级农业部门。

6、签章：在证书下方留出空白处，用于盖发证机关的公章。

需要注意的是，填写高级农艺师证书发证机关时，应该准确无误地填写相关信息，以免影响后续的工作和使用，也要注意保管好自己的高级农艺师证书，以备不时之需。